昆明市第三人民醫(yī)院成立于1954年，前身為“昆明市傳染病醫(yī)院”,1986年更名為昆明市第三人民醫(yī)院，2002年與“昆明市結核病防治院”合并，成為西南地區(qū)規(guī)模最大的傳染病專科醫(yī)院，2016年3月通過“三級甲等傳染病?？漆t(yī)院”評審，是“云南省傳染性疾病診療質量控制中心”和“昆明市傳染性疾病醫(yī)療質量控制中心”，是昆明市政府舉辦的以傳染性疾病診治為重點，集醫(yī)療、教學、科研、社區(qū)衛(wèi)生服務為一體的大型綜合性傳染病專科醫(yī)院。醫(yī)院是大理大學第六附屬醫(yī)院、昆明醫(yī)科大學臨床教學醫(yī)院。

醫(yī)院有3個專家工作站：首都醫(yī)科大學附屬北京佑安醫(yī)院鄭加生專家工作站（微創(chuàng)介入科）、中國藥科大學孔令義專家工作站（天然藥物化學）及首都醫(yī)科大學附屬北京地壇醫(yī)院成軍專家工作站（肝病科）。

醫(yī)院有省級重點?？?個（感染性疾病科、傳染科、重癥醫(yī)學科、肝病科）和培育項目1個（結核病科），市級重點?？?個（肝病科、結核病科、艾滋病科、重癥醫(yī)學科），設有3個昆明市市級研究中心（昆明市感染性疾病研究中心、昆明市肝病研究中心、昆明市結核病臨床研究中心）、1個昆明市重點實驗室（昆明市結核病重點實驗室）、23個市級診療技術中心和4個科技創(chuàng)新團隊，是昆明市“突發(fā)公共事件傳染病醫(yī)療救治中心”。

醫(yī)院分為吳井、長坡兩個院區(qū)，現有職工1099名，其中具備碩博學歷的118人，高級職稱138人，碩導10人，編制床位1200張，設有中西醫(yī)結合結核病科、耐藥與重癥結核病科、綜合結核病科、介入結核科、結核病臨床檢驗中心、肝病綜合科、肝病介入科、肝病免疫科、肝病消化科、性病與艾滋病科、感染性疾病及兒童傳染科、重癥醫(yī)學科、關懷科、腫瘤科、骨科、普外科、胸外科、婦產科、麻醉科、呼吸科、心內科、內分泌科、老年肺病科、老年心腦血管疾病科、血液凈化中心、介入導管室、預防保健與慢病管理中心、檢驗科、醫(yī)學影像科、超聲功能科、藥學部、營養(yǎng)科等32個臨床及11個醫(yī)技輔助科室。

致力于建設國內一流的綜合性傳染病醫(yī)院，為病友提供方便周到的人性化服務。醫(yī)院業(yè)務范圍輻射全省、周邊省份和東南亞國家，近年來與美國斯坦福大學、瑞典隆德大學及泰國宋卡王子大學、越南國立肺科醫(yī)院、柬埔寨馬德望省立醫(yī)院、印度尼西亞廖亞大學、緬甸衛(wèi)生部國家結核項目辦、老撾友誼醫(yī)院等東南亞一帶一路國家的專業(yè)機構開展了廣泛的學術和技術交流，隨著專業(yè)細分及學科交叉的不斷深入，逐步形成了“精專科、強綜合”的格局。

2017年以來醫(yī)院陸續(xù)加入了“北京結核病診療技術創(chuàng)新聯盟”、“國家肝臟腫瘤微創(chuàng)治療技術創(chuàng)新戰(zhàn)略聯盟”和 “北京亞太肝病診療技術創(chuàng)新聯盟”，在京昆醫(yī)療協(xié)作聯盟的支持下成立了亞太肝病診療技術聯盟云南省聯盟、成為全國結核病醫(yī)院聯盟和北京結核病診療技術創(chuàng)新聯盟醫(yī)院，是西南結核病醫(yī)院聯盟的副主委單位，是全國首批上線的結核病互聯網醫(yī)院，是全國傳染病醫(yī)院管理創(chuàng)新學組的委員單位。率先引入的電磁導航支氣管鏡技術提升了肺部結節(jié)的鑒別診斷能力，結核病臨床研究中心在耐多藥結核的診治、中西醫(yī)結合肺內外結核的治療、肺結核及結核并發(fā)癥的介入治療、骨關節(jié)結核的外科治療等方面達到國內先進水平。肝病臨床研究中心在感染性肝病如乙肝、丙肝、戊肝等和非感染性肝病如自免肝、脂肪肝、藥物肝損傷等診療方面處于省內領先水平，是云南省最早開展人工肝治療的醫(yī)院，開展了肝硬化及上消化道出血的內鏡治療，在“鄭加生專家工作站”的指導下開展了肝癌與肺癌的微創(chuàng)介入消融手術，具備開展肝癌的肝動脈灌注栓塞、肝血管瘤灌注栓塞、經頸靜脈肝內門體分流術、下腔靜脈濾器植入等介入手術的能力。醫(yī)院建立了HIV初篩和確證實驗室，具備開展抗病毒治療、機會性感染治療、母嬰阻斷、HIV外科手術等完善的艾滋病診療體系。感染性疾病科對發(fā)熱感染性疾病、中樞神經系統(tǒng)感染性疾病及蟲媒傳播疾病的診療水平省內領先。重癥醫(yī)學科對重癥肺炎、休克、多器官功能衰竭、呼吸衰竭、腎功能衰竭、藥物毒物中毒以及重癥艾滋病、重癥結核、急慢性肝衰竭、破傷風、腦炎等感染性危重癥有豐富的救治經驗。心內科可開展冠脈介入、心臟起搏、主動脈瘤腔內隔絕術等介入治療。呼吸科擅長對疑難肺部疾病的臨床診治。骨科開展創(chuàng)傷骨折、骨腫瘤、骨與脊柱關節(jié)結核的手術，腹部外科開展腹腔鏡術、肝葉切除術以及其他腹部結核手術，胸外科開展肺腫瘤、各種結核病灶清除和肺葉切除等手術。婦產科是云南省定點施行乙肝、梅毒、HIV母嬰阻斷的單位，目前所完成的HIV感染手術在國內位居前列。醫(yī)院血液凈化中心是“全國人工肝及血液凈化技術示范中心”，分室分機，對各種感染性疾病患者及普通患者按感染途徑進行分區(qū)專人專機治療，確?；颊叩轿以褐委煹陌踩?。為終末期病人提供緩和醫(yī)療和安寧療護服務的關懷科在國內享有較高知名度，是“昆明市安寧療護技術中心”，并與瑞典隆德大學合作共建“中瑞安寧療護中心”。醫(yī)院檢驗科在病毒性肝炎、結核、艾滋病及其他傳染病的臨床檢測方面處于省內領先水平。

作為云南省傳染性疾病診療質量控制中心，昆明市第三人民醫(yī)院是唯一一家以市級醫(yī)院的身份承擔起省級醫(yī)療質控中心任務的醫(yī)療衛(wèi)生機構，牽頭建立了云南省感染性疾病?？坡撁?，目前已覆蓋三級醫(yī)療機構5個、二級醫(yī)療機構15個、一級醫(yī)療機構11個，聯盟單位包括昆明市14縣市區(qū)人民醫(yī)院，部分地州醫(yī)院：個舊市傳染病醫(yī)院、紅河州人民醫(yī)院、紅河州傳染病醫(yī)院、楚雄州人民醫(yī)院、麗江市人民醫(yī)院、迪慶州人民醫(yī)院、怒江州人民醫(yī)院、瀘西縣人民醫(yī)院、鎮(zhèn)雄縣人民醫(yī)院等；響應國家“一帶一路”倡議，不斷擴大與省內外及東南亞國家傳染病專業(yè)機構間的協(xié)作范圍，積極搭建東南亞感染性疾病聯盟的平臺，通過醫(yī)療合作、學術交流、項目、科研等方式帶動區(qū)域內傳染病防治水平的共同提升。

近年來醫(yī)院在科研創(chuàng)新方面成果顯著：獲得國家自然科學基金立項1項，云南省部級立項24項，昆明市級立項108項，昆明市引智項目立項7項，區(qū)級項目3項；獲云南省科技進步二等獎1項、三等獎1項，云南省衛(wèi)生科技成果二等獎2項、三等獎7項，昆明市科技進步二等獎2項、三等獎1項，官渡區(qū)科技進步三等獎2項。

醫(yī)院承擔著昆明地區(qū)的傳染病臨床診療、預防控制、應急救治、技術指導、人員培訓等工作，是昆明市及云南省傳染病疫情防控的重要力量，為保障昆明市乃至云南省人民群眾的身體健康、維護社會穩(wěn)定做出了積極貢獻。2003年被衛(wèi)生部、人事部、國家中醫(yī)藥管理局表彰為“全國衛(wèi)生系統(tǒng)抗擊非典先進集體”；2005-2007年度、2008-2010年度及2011-2015年度三次獲得“云南省防治艾滋病人民戰(zhàn)爭先進集體”榮譽；2009年、2012年、2015年連續(xù)三次被授予“云南省文明單位”稱號；2012年、2013年被評為昆明市“平安建設先進單位”，多次獲得市衛(wèi)生系統(tǒng)“先進集體”、“實績突出班子”等表彰；2017年艾滋病科獲得國家衛(wèi)計委授予的“全國優(yōu)質護理服務表現突出病房”稱號、獲得國家衛(wèi)計委授予的“全國衛(wèi)生計生系統(tǒng)先進集體”稱號及云南省衛(wèi)計委授予的“云南省衛(wèi)生計生系統(tǒng)先進集體”稱號；2019年在“健康春城?最美醫(yī)者”評選活動中同時獲得“五一勞動獎章” 和“工人先鋒號”光榮稱號。